يهتم المؤتمر بكافة الاختصاصات العلميِّة في القرآن والسنة المرتبطة بكل التخصصات الأكاديمية وتتضمن:
المحور الأول: فلسفة علم الإعجاز
أسسه، ضوابطه، مناهجه، نظرياته، مصطلحاته، حقوله، تطبيقاته، مصادره، مقاصده.
المحور الثاني: نتائج علوم الإعجاز وتطبيقات تجديد علوم الدين
- تجديد الخطاب الإسلامي الدعوي
- التجديد في علم التفسير القرآني
- التجديد في فهم علم التوحيد
- التجديد في علم الحديث النبوي
- التجديد في الفقه وأصوله
- التجديد في قضايا تاريخ المجتمعات
المحور الثالث: علوم الإعجاز ومقاربات التجديد في مؤسسات التعليم والمراكز البحثية
- تطوير المناهج الدراسية في مراحل التعليم الأساسي والجامعي.
- تطوير المؤسسات الأكاديمية والمراكز البحثية العاملة في مجالات الإعجاز.
- القراءات النقدية والدراسات التصحيحية
- مصادر تمويل الأبحاث والدراسات.
المحور الرابع: المشاريع العلمية والأبحاث المبتكرة
- في حقل الدراسات الإنسانية.
- في الجيولوجيا وعلوم البحار
- في حقل البيولوجيا وعلوم الأحياء
- في حقل الفيزياء والفلك
المحور الخامس: استشراف مستقبل الإعجاز العلمي في القرآن الكريم والسنة النبوية.
- دراسة تجارب سابقة ( تجربة ماليزيا - اليمن - مصر - المغرب - تركيا - أوروبا - أمريكا)
- دراسة إسهامات وجهود المهتمين بالإعجاز العلمي للقرآن الكريم والسنة النبوية في ليبيا.